Создан пептид для доставки веществ к мишеням в клетке

Исследователи из Великобритании и Германии создали de novo белок, который представляет собой антипараллельный гетеродимер. Одна часть димера локализуется в нужном клеточном компартменте или метит молекулярный комплекс, вторую связывают с веществом (например, препаратом или красителем) и добавляют к клеткам. Две части белка соединяются, и вещество оказывается в таргетируемой области.

Credit:
123rf.com

В последние годы были разработаны различные активные вещества, способные влиять на процессы, происходящие внутри клеток. Но доставка этих веществ в целевые клеточные компартменты — это уже другая задача. Некоторые молекулы могут захватываться клеткой путем эндоцитоза и попадать в эндолизосомальную систему. Но это не гарантирует их доставку до цели. Исследователи из Великобритании и Германии создали de novo белок, способный транспортировать вещества (например, препараты или красители) в различные клеточные структуры.

Для решения этой проблемы ученые разработали специальный СС-пептид (СС — coiled coil, или так называемая «спиральная катушка»). Такой пептид состоит из двух альфа-спиралей, свернутых вместе. Изначально было сконструировано два пептида: антипараллельный гомодимер apCC-Di и антипараллельный гетеродимер apCC-Di-AB, состоящий из apCC-Di-A и apCC-Di-B, но в конце концов исследователи сосредоточились на втором. Одна из частей белка была обогащена аргинином, а другая — аспартатом.

Авторы подробно изучили строение и свойства полученного пептида. Они показали, что его компоненты подходят друг к другу, как «ключ к замку», образуя связи между аргинином и аспартатом. Также ученые подтвердили антипараллельную природу димера. При введении флуоресцентного красителя и гасителя флуоресценции в антипараллельные структуры наблюдалось гашение красителя, в то время как в параллельных конструкциях присутствовал флуоресцентный сигнал. У полученного пептида флуоресценции не наблюдалось. То же показали эксперименты на клетках Escherichia coli.

На следующем этапе ученые попробовали транспортировать вещества в клетки культуры HeLa с помощью полученного гетеродимера. N-конец димеров A и B пометили флуорофором TAMRA. Пептиды добавляли к культуре клеток, через час наблюдали результат: в цитозоль клеток попадал только пептид apCC-Di-B, обогащенный аргинином.

Кроме того, авторы подтвердили, что apCC-Di-B, поглощенный клеткой, по-прежнему может связываться с apCC-Di-A. Для этого в клетку внедряли плазмиду, с которой экспрессировался белок apCC-Di-A, меченный GFP, после чего добавляли TAMRA-apCC-Di-B. Авторы продемонстрировали совместную иммунопреципитацию этих двух белков.

Далее авторы получили комплекс apCC-Di-А с лизосомальными мембранными белками в клетках, а затем к культуре добавили TAMRA-apCC-Di-B. Пептид успешно метил выбранный компартмент.

Также авторы показали, что apCC-Di-B может доставлять в клетку функциональные пептиды, например, лиганд кинезина 1 KinTag. Для этого клетки, экспрессирующие LAMP1–mGFP–apCC-Di-A, обрабатывали пептидом TAMRA-KinTag–apCC-Di-B. Результаты эксперимента подтвердили, что в клетке образовался комплекс apCC-Di-AB. Это означает, что пептид был доставлен.

Авторы подчеркивают, что разработанные ими пептиды могут быть использованы для импорта веществ внутрь клетки в различных целях. Синтез белков de novo — это один из многообещающих методов, который поможет осуществлять доставку молекул, лекарств или красителей в клетки.

Источник

Rhys G.G., et al. De novo designed peptides for cellular delivery and subcellular localisation. Nature Chemical Biology (2022), July 14, 2022. DOI: 10.1038/s41589-022-01076-6

Добавить в избранное

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта. Узнать больше.

Настройки файлов cookie

Мы используем файлы cookie для улучшения работы сайта, анализа трафика и показа персонализированной рекламы. Вы можете изменить настройки в любой момент.

Категории файлов cookie:

Необходимые

Эти cookie обеспечивают базовую функциональность сайта — вход в аккаунт, безопасность, оформление заказов. Отключение невозможно.

Функциональные

Функциональные cookie используются для обеспечения работы отдельных функций сайта, а также для запоминания ряда пользовательских предпочтений (например, выбранный язык, товары в корзине), с целью улучшения качества предоставляемого сервиса.

Отключение этого типа файлов cookie может привести к тому, что некоторые сервисы или функции сайта станут недоступны или будут работать некорректно. В результате, вам может потребоваться повторно вводить определённую информацию или настраивать предпочтения при каждом посещении сайта вручную.

Аналитические

Аналитические файлы cookie, включая сторонние аналитические cookie, помогают нам понять, как вы взаимодействуете с нашим сайтом. Эти файлы не собирают информацию, позволяющую установить вашу личность. Все данные обрабатываются в агрегированной и анонимной форме.

Рекламные

Рекламные cookie, включая сторонние, используются для создания пользовательских профилей и показа рекламы, соответствующей вашим интересам и предпочтениям при просмотре сайтов.

Эти cookie позволяют персонализировать рекламные сообщения, которые вы видите, делая их более релевантными. Они также могут использоваться для ограничения количества показов одной и той же рекламы и для оценки эффективности рекламных кампаний.