Меню
Все темы
Поиск:
- Все
- А
- Б
- В
- Г
- Д
- Е
- Ё
- Ж
- З
- И
- Й
- К
- Л
- М
- Н
- О
- П
- Р
- С
- Т
- У
- Ф
- Х
- Ц
- Ч
- Ш
- Щ
- Э
- Ю
- Я
- Все
- A
- B
- C
- D
- E
- F
- G
- H
- I
- J
- K
- L
- M
- N
- O
- P
- Q
- R
- S
- T
- U
- V
- W
- X
- Y
- Z
- Анализ обогащения по функциональной принадлежности
- Анализ обогащения по функциональной принадлежности (gene set enrichment analysis, GSEA) – совокупность методов для определения зависимости фенотипа организма от генотипа. Анализ учитывает функциональные связи аннотированных генов. Для формализации существующих данных о фенотипе такие методы часто используют базы данных предварительно аннотированных наборов генов, например, датасеты проекта Gene Ontology. GO включает классификации по молекулярным функциям продукта гена (связывание углеводов, определенная ферментативная активность и т.п.), биологическим процессам, в которых они участвуют, и клеточным компонентам, где они локализованы. Результатом применения метода (выдачей программы) в этом случае является множество преаннотированных наборов, частота встречаемости которых во входном наборе статистически значимо отличается от фоновой (например, частоты во всем геноме или в другом наборе генов). Такие преаннотированные наборы называют перепредставленными (если частота выше фоновой) или недопредставленными (если частота ниже фоновой).
