Коротко

В октябре 2022 года произошла вспышка инфекции, вызванной высокопатогенным вирусом птичьего гриппа H5N1, среди норок на одной из испанских ферм. Изначально виновником вспышки посчитали SARS-CoV-2, однако вскоре лабораторные исследования указали на вирус гриппа. Работников немедленно поместили на карантин. Было убито более 50 000 норок.

Статья с описанием вспышки вышла на прошлой неделе в Eurosurveillance. Геномный и филогенетический анализ возбудителя показали его принадлежность к кладе 2.3.4.4b и выявили нетипичную мутацию T271A в гене PB2. Вирус гриппа этой клады обнаружен у норок впервые. Мутация T271A до сих пор не детектировалась в европейских высокопатогенных вирусов птичьего гриппа типа H5 и могла возникнуть de novo в норках. В то же время авторы работы не исключают скрытой циркуляции H5N1 с такой мутацией в птичьих популяциях.

Ранее высокопатогенный вирус птичьего гриппа H5N1 был обнаружен у лис в Нидерландах. Он также принадлежал к кладе 2.3.4.4b. Основываясь на генетическом анализе и результатах экспериментов, ученые пришли к выводу, что за приспособление к лисам в этом случае отвечает мутация 627K в гене PB2.

Исследователи из ЦНИИ организации и информатизации здравоохранения опросили 2 725 человек (45,6% мужчин, 54,4% женщин), чтобы узнать, с какой целью они принимают антимикробные препараты и что им известно об устойчивости бактерий к антибиотикам.

За последний год антибиотики принимали 54,6% респондентов (1489 человек), из них чуть менее половины — по собственной инициативе. Вероятность самолечения антибиотиками была меньше, если пациент обращался к врачу, и больше, если лечился самостоятельно. Три четверти лечившихся антибиотиками (72,5%, 1080 человек) делали это неправильно; они сообщили о преждевременном прекращении курса (323 человека) или о том, что принимали антибиотики при вирусных инфекциях, симптомах простуды, для профилактики. Практически все опрошенные (87,9%) были осведомлены о том, что прием антибактериальных препаратов без назначения врача является опасным и неэффективным. Однако при этом 41% опрошенных согласился с утверждением, что антибиотики убивают вирусы, и более 60% не знало, что неправильный прием антибиотиков снижает их эффективность не только для самого пациента, но и для других людей.

14 февраля 2023 года Genetico и Московский центр инновационных технологий в здравоохранении приглашают врачей-генетиков и всех специалистов смежных областей, которые в своей практике сталкивается с генетикой, на традиционный симпозиум, который в этом году будет носить название Genetico.Ethics.

Genetico.Ethics — это научно-практическое событие, посвящённое этическим вопросам в генетике, с которыми сталкиваются в своей практике врачи-генетики, сотрудники генетической лаборатории и специалисты смежных областей при проведении исследований и работе с пациентами.

На конференции будут обсуждаться этические вопросы о статусе эмбриона (и необходимости защиты их прав), этических моментах в НИПТ, донорстве, неожиданных находках во время генетических исследований, юридических аспектах вопроса, интересных и нестандартных кейсах из практики врачей. Программа мероприятия построена так, чтобы участники могли не только послушать доклады и задать вопросы спикерам в официальной части программы, но и в неформальной обстановке обсудить с коллегами способы решения сложных этических ситуаций в практике.

Регистрация

В The Lancet Infectious Diseases опубликованы результаты фазы 1 рандомизированных плацебо-контролируемых КИ двух мРНК-вакцин против вируса Зика, mRNA-1325 и mRNA-1893. Оба препарата разработаны компанией Moderna. Вакцина mRNA-1325 кодирует белки prM и E изолята вируса Зика Micronesia 2007; mRNA-1893 несет гены тех же белков, но другого изолята — RIO-U1.

В испытаниях приняли участие здоровые добровольцы в возрасте 18–49 лет без антител к вирусу. Вакцины тестировались в различных дозировках. К испытанию mRNA-1325 было привлечено 90 человек, к испытанию mRNA-1893 — 120 человек. Вакцинация проводилась по двухдозовой схеме. Оценивались безопасность и иммуногенность препаратов.

Все дозы mRNA-1325 переносились хорошо, но иммунный ответ на препарат был слабым. Препарат mRNA-1893 вызывал побочные эффекты, особенно в более высоких дозировках и после второй дозы, но в то же время он индуцировал высокий титр нейтрализующих антител против вируса Зика.

Авторы исследования сделали вывод, что вакцина mRNA-1893 подходит для дальнейшей разработки.

ПреРНК эукариот после транскрипции подвергаются сплайсингу — удалению интронов. В результате образуются несколько видов зрелых РНК, в том числе кольцевые, или циклические (circRNA, цРНК). Они могут соответствовать как интронным, так и экзонным последовательностям линейных РНК. Следует различать цРНК и стабильную интронную РНК, по каким-то причинам не подвергнутую деградации: концы интронов, замкнутых в кольцо, соединены фосфодиэфирной 2',5'-связью, а концы цРНК — обычной 3',5'-связью.

Известно множество кольцевых молекул РНК — сотни функциональных молекул стабильной интронной РНК и сотни тысяч цРНК. Авторы комментария, опубликованного в Nature Cell Biology, призывают научное сообщество во избежание путаницы принять единую номенклатуру для цРНК.

Сейчас подавляющее их большинство носит названия, образованные добавлением префикса «circ» к названию гена-хозяина; эта стратегия не позволяет различать цРНК, считанные с одного гена. Авторы предлагают включать в название обозначения экзонных и интронных компонентов в составе цРНК: не circCOX5A, а circCOX5A(2,3) и circCOX5A(3,4), где цифры — номера экзонов. Сохраненную интронную последовательность предложено обозначать RI, тогда кольцевые РНК с интронным участком и без него могут называться, например,  circCAMSAP1(2,RI,3) и circCAMSAP1(2,3). Также предложены способы именования цРНК с альтернативным сплайсингом, новыми (ранее не аннотированными) экзонами и цРНК, возникших из двух генных последовательностей в результате транслокации. Схемы именования интуитивно понятны и подходят для любых эукариотических видов, считают авторы.

Американские ученые и врачи проанализировали заболеваемость пожилых людей респираторными инфекциями, вызванными респираторно-синцитиальным вирусом (РСВ), до пандемии COVID-19 и во время ее. В исследование были включены 2 325 жителей Миннесоты старше 50 лет. Их наблюдали в течение двух «простудных» сезонов (2019–2021 гг.). До пандемии (октябрь 2019 г. — апрель 2020 г.) частота РСВ-положительных острых респираторных инфекций составляла 48,6 на 1000 человеко-лет. В период с октября 2020 г. по апрель 2021 г. ни одна из острых респираторных инфекций не была связана с РСВ. Затем в течение лета 2021 г. встречаемость РСВ-инфекций составила 10,2 на 1000 человеко-лет. РСВ-ассоциированные инфекции были связаны с ухудшением качества жизни. Оно было выражено сильнее, чем у пациентов с респираторными инфекциями, не связанными с РСВ. Некоторые осложнения после РСВ, например, утомляемость, трудности с социальным взаимодействием и эмоциональные проблемы, сохранялись длительное время — до 12–13 месяцев после диагноза.

Гора Фудзи изобилует источниками безопасной питьевой воды, богатой ванадием. В последнее время качество воды снижается, но существующая гидрогеологическая модель не может это объяснить. Чтобы решить эту проблему, международная команда ученых проследила происхождение воды Фудзи, используя в качестве меток ванадий, гелий и экологическую ДНК. Так, анализируя микробную эДНК, они заметили, что при увеличении напора воды доля архей YLA114 и WCHD3-30 падает. Это означает, что они живут в суспензии, а не прикрепляются к субстрату. Ранее ДНК YLA114 и WCHD3-30 обнаруживали в экстремальных местообитаниях. Их присутствие в воде Фудзи может свидетельствовать о ее подъеме с очень больших глубин. Авторы отмечают, что это первое исследование, в котором эДНК использовалась наравне с другими геологическими метками. Более того, две другие метки «рассказали ту же историю» о циркуляции воды в глубинах горы и вертикальном взаимодействии между водоносными горизонтами. Таким образом, исследованием расширило понимание гидрогеологии Фудзи и показало потенциал эДНК в качестве метки для подобных исследований.

Работа опубликована в Nature Water.

При анализе результатов рандомизированного исследования VITAL, в рамках которого оценивался эффект витамина D и омега-3 жирных кислот, ученые заметили, что витамин D снижает риск тяжелых исходов для здоровых индивидов с нормальным, но не повышенным весом. В новой работе они решили уточнить ассоциации метаболизма витамина D с индексом массы тела.

Ученые проанализировали данные 16 515 участников VITAL, сдавших кровь до рандомизации. Общий уровень основного метаболита витамина D, 25(OH)D, в крови был тем ниже, чем выше был BMI. Такие же тенденции прослеживались для других биомаркеров крови, связанных с метаболизмом витамина D: 25(OH)D3, свободного витамина D, биодоступного витамина D, витамин D-связывающего белка, альбумина, паратгормона и кальция. Для 2 742 участников были доступны образцы крови, взятые после курса витамина D или плацебо. У всех индивидов, получавших витамин D, уровни общего 25(OH)D, 25(OH)D3, свободного витамина D и биодоступного витамина D увеличились, но для групп с повышенным BMI этот эффект был выражен гораздо слабее. Витамин D не повлиял на концентрации витамин D-связывающего белка, альбумина, паратгормона или кальция.

Авторы исследования выдвинули две гипотезы, связывающие метаболизм витамина D и BMI. Согласно первой, жирорастворимый 25(OH)D поглощается адипозной тканью. В результате его количество и активность в крови падают. Другая гипотеза гласит, что метаболизм витамина D нарушается из-за дисфункции печени, индуцированной ожирением. Для уточнения механизма необходимы дальнейшие исследования. В любом случае индекс массы тела стоит учитывать при расчете эффективных доз витамина D.

Работа опубликована в JAMA Network Open.

В начале января компания BioMarin обнародовала результаты трехлетних наблюдений за участниками фазы 3 КИ генной терапии гемофилии A. На сегодня это самое большое и продолжительное испытание генотерапевтического препарата от гемофилии: оно охватило 134 пациента. Первые 22 участника сразу получили однократную инфузию препарата ROCTAVIAN — вектора на основе аденоассоциированного вируса типа 5, несущего ген фактора свертываемости крови VIII. Остальные 112 участников на первом этапе не менее шести месяцев принимали препарат фактора крови VIII. В это время оценивались качество их жизни и частота кровотечений. Затем они также получили ROCTAVIAN.

В третий год после инфузии генотерапевтического вектора среднее количество кровотечений было на 80% по сравнению с исходным, а количество приемов экзогенного фактора VIII — на 94% ниже. К концу третьего года 92% участников не нуждались в препаратах фактора VIII. По словам представителя BioMarin, полученные данные укрепили веру в то, что ROCTAVIAN может коренным образом изменить терапию гемофилии А.

Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний США и HIV Vaccine Trials Network сообщают об остановке проекта Mosaico (PX3002/HVTN706) — фазы 3 КИ вакцины против ВИЧ, основанной на аденовирусном векторе. Обоснованием послужили промежуточные результаты.

КИ Mosaico началось в 2019 году и охватило 3 900 мужчин, практикующих секс с мужчинами, и трансгендеров в возрасте 18–60 лет. Схема вакцинации предполагала введение четырех доз аденовирусного вектора Ad26.Mos4.HIV, кодирующего «мозаику» иммуногенов разных подтипов ВИЧ, в течение года. Кроме того, в третий и четвертый визиты участники получали растворимый белковый компонент, который состоит из оболочечного гликопротеина gp140 клады C и мозаичного gp140, дополненных фосфатом алюминия в качестве адъюванта. Иммунизация всех участников завершилась в октябре 2022 г. Во время плановой оценки результатов испытания независимая комиссия по мониторингу и безопасности данных признала схему вакцинации безопасной, но неэффективной.

То же самое произошло осенью 2021 года с КИ Imbokodo, в котором Ad26.Mos4.HIV тестировался по другой схеме.

Теперь организаторы Mosaico сообщат участникам, в какой группе они состояли (вакцины или плацебо), и позаботятся о том, чтобы все индивиды, заразившиеся ВИЧ, начали лечение.