Коротко

На этой неделе в Genetics in Medicine вышел обзор, посвященный эффективности неинвазивного пренатального скрининга (НИПС). НИПС используют для детекции анеуплоидий у плода по внеклеточной ДНК из крови матери. Авторы обзора проанализировали 87 исследований, в которых с помощью НИПС определяли трисомии по 21, 18 и 13 хромосомам (Т21, Т18 и Т13), анеуплоидии по половым хромосомам, вариации числа копий и заболевания матери либо изучали влияние НИПС на психологическое состояние матери и прохождение дальнейших диагностических тестов. Они показали, что НИПС с определяет Т21, Т18 и Т13 при беременности одним или двумя плодами с высокой чувствительностью и специфичностью. Для других состояний эффективность НИПС варьировала. Однако авторы предупреждают, что в случае положительного результата НИПС по любому из отклонений необходимо дальнейшее диагностическое тестирование.

Согласно исследованию, опубликованному в CMAJ, загрязнение воздуха ассоциировано с тяжестью COVID-19. Работа выполнена на когорте жителей провинции Онтарио (Канады) в возрасте от 20 лет и старше, у которых в 2020 году было подтверждено заражение SARS-CoV-2. Из 151 105 пациентов 8 630 были госпитализированы, 1 912 попали в отделение интенсивной терапии. Зарегистрировано 2 137 смертей, связанных с COVID-19. Ученые проверили связь длительного воздействия таких загрязнителей воздуха, как взвешенные в воздухе твердые мипкрочастицы, NO₂ и приземный озон, с риском госпитализации, необходимостью в интенсивной терапии и смертью. При статистическом анализе учитывались дата постановки диагноза, пол, возраст, трудовой статус, социально-экономический статус окружения, доступ к медицинской помощи и другие факторы. Хроническое воздействие взвешенных микрочастиц ассоциировано с повышенным риском госпитализации, а хроническое воздействие приземного озона — с повышенным риском смерти. По словам авторов, ассоциации прослеживались даже при относительно низких концентрациях загрязнителей. Это и другие подобные исследования могут дать важную информацию для систем общественного здравоохранения.

На конференции London Calling 2022, которая прошла 18–20 мая, главный технический директор Oxford Nanopore Technologies Клайв Браун сообщил о прогрессе в секвенировании белков. По его словам, теперь технология позволяет получать воспроизводимые профили молекул, состоящих из более чем одной аминокислоты. Однако это только начало пути. Нанопоровое секвенирование белков осложнено их фолдингом и модификации сахарами. ONT тестирует несколько подходов. Браун отметил один из них — метод ДНК-пептидных конъюгатов. При протягивании через пору пептиды связываются с двухцепочечной молекулой ДНК. Технических деталей Браун не раскрыл, однако отметил, что кроме ONT похожий метод для секвенирования белков использует команда из Делфтского технического университета (Нидерланды) и Иллинойсского университета в Урбане-Шампейне (США). Соответствующая статья последних была опубликована в 2021 году в Science. Пересекается ли интеллектуальная собственность ONT и ученых из Делфта, неизвестно.

В будущем ONT планирует проводить шотган-секвенирование сложных белковых смесей из биологических образцов. Цель компании — сделать возможным секвенирование белков на то же нанопоровой платформе, которая сейчас используется для секвенирования ДНК.

Во время пандемии COVID-19 одним из способов оценить распространение инфекции стал мониторинг вируса SARS-CoV-2 в сточных водах. Как сообщает The New York Times, в некоторых частях США результаты анализа сточных вод вызывают беспокойство, так как могут предвещать новую волну COVID-19. В частности, нужно быть настороже жителям Нового Орлеана и Хьюстона. По словам главы департамента здравоохранения Нового Орлеана, ситуация похожа на вспышку в замедленной съемке. Резких пиков, похожих на таковые в периоды доминирования дельты и омикрона, не наблюдается. На основе данных мониторинга сточных вод в Новом Орлеане усилили программы по вакцинации и распространению масок. Специалисты из Хьюстона надеются, что предупреждение о новой волне инфекции поспособствует соблюдению мер предосторожности среди населения.

С началом пандемии число операций по трансплантации печени не снизилось. Это удивительно, так как многие операции в этот период отменялись или переносились. Оказалось, что увеличилось число доноров, которые погибли от передозировки наркотиков. Об этом исследователи из США доложили на Неделе заболеваний пищеварительного тракта 2022 (Digestive Disease Week 2022).

Ранее ученые показали, что органы жертв передозировки можно безопасно пересаживать. Такие доноры обычно молоды и редко страдают от гипертензии и диабета. Исследователи сравнили два периода — 14 месяцев до пандемии и 14 месяцев во время пандемии. Они обнаружили, что процент доноров печени, умерших от передозировки, вырос на 26% — с 15,1% до 18,3%. Авторы предположили, что причина в социоэкономических стрессорах, связанных с пандемией.

Большой международный коллектив ученых опубликовал в The Lancet отчет о влиянии респираторно-синцитиального вируса на глобальное здравоохранение в 2019 году. РСВ — наиболее распространенная причина острых инфекций нижних дыхательных путей у детей младше пяти лет. Предыдущий анализ показал, что в 2015 году такие инфекции стали причиной гибели 118 200 детей. В новой работе ученые использовали данные 317 исследований, рассмотренных ранее, 113 новых опубликованных исследований, а также неопубликованные данные 51 исследования. По их оценкам, в 2019 году произошло 33 млн. случаев острой инфекции нижних дыхательных путей, ассоциированной с РСВ; 3,6 млн. госпитализаций в связи с инфекцией; 26 300 смертей в больнице и 101 400 смертей от РСВ в целом среди детей в возрасте от 0 до 5 лет. Для младенцев (0–6 мес.) эти показатели были равны 6,6 млн., 1,4 млн., 13 300 и 45 700. Более 95% случаев РСВ-ассоциированной инфекции нижних дыхательных путей и более 97% смертей, связанных с РСВ, среди всех возрастных групп приходятся на страны с низким и средним уровнем дохода.

По мнению авторов, в ходе анализа удалось определить самую уязвимую возрастную группу — дети до полугода. Именно на нее, а также на беременных женщин, должны быть направлены стратегии вакцинации против РСВ.

Австралия сегодня сообщила о первом на территории страны случае обезьяньей оспы у путешественника, вернувшегося из Великобритании. По информации департамента здравоохранения штата Виктория, 30-летний мужчина, прибывший в Мельбурн в понедельник, заражен вирусом, еще один вероятный случай выявлен в Сиднее у мужчины в возрасте 40 лет, который недавно путешествовал по Европе. У обоих развилось легкое заболевание.

В среду Департамент общественного здравоохранения штата Массачусетс подтвердил случай заражения вирусом обезьяньей оспы у мужчины, который недавно ездил в Канаду. Человек госпитализирован, его состояние не представляет угрозы, контакты отслеживаются.

Агентство общественного здравоохранения Канады вечером в среду сообщило, что внимательно следит за ситуацией. После расследования 17 подозрительных случаев в четверг агентство подтвердило два случая заражения вирусом оспы обезьян.

Ранее случаи обезьяньей оспы были выявлены в Великобритании, Португалии и Испании. (Семь случаев в Испании уже подтверждены.) В Великобритании предлагают вакцинировать от оспы работников здравоохранения, которые подвергаются наибольшему риску инфицирования.

Ученые подсчитали, сколько живых микробов потребляют с пищей взрослые и дети в США. Они работали с данными исследования NHANES, посвященного питанию американцев. Новая работа охватила 74 466 индивидов. Содержание живых микроорганизмов в различных типах пищи было оценено экспертами и классифицировалось как низкое (Lo, менее 10⁴ КОЕ/г), среднее (Med, 10⁴–10⁷ КОЕ/г) и высокое (Hi, более 10⁷ КОЕ/г). Предполагалось, что низкий уровень живых микробов характерен для пастеризованных продуктов, средний — для свежих неочищенных овощей и фруктов, высокий — для непастеризованных ферментированных продуктов и пробиотиков. Учитывая специфику питания исследуемой группы, авторы оптимизировали классификацию продуктов, выделив категории Med, Hi и MedHi. Оказалось, что с продуктами из этих категорий дети и подростки съедают по 69, 16 и 85 грамм живых микробов в день, соответственно, взрослые — по 106, 21 и 127 г/день. Ученые отмечают, что потребление пищи с живыми микробами в США постепенно растет. Такой вывод они сделали, сравнивая самые ранние данные, полученными в 2001–2002 гг., с самыми последними данными за 2017–2018 гг. Необходимы дополнительные исследования, чтобы понять, как уровень потребления живых микробов связан с состоянием здоровья.

Некоммерческая исследовательская организация IAVI и компания Moderna сообщают о скором начале отбора участников для фазы 1 клинических испытаний мРНК-вакцины против ВИЧ — mRNA-1644 — в Центре исследований здоровья семьи (CFHR) в Кигали, Руанда, и в Институте Аурум в Тембисе (ЮАР).

Вакцина содержит мРНК, которая кодирует фрагмент поверхностного белка ВИЧ gp120; он способен собираться в 60-меры. (Подробнее об этом белке под названием eOD-GT8 и других подходах к разработке вакцины против ВИЧ на PCR.NEWS.) Предполагается, что eOD-GT8 в виде белковой или мРНК-вакцины будет использоваться в многоступенчатой схеме вакцинации, которая обеспечит появление широконейтрализующих антител против ВИЧ. Сам по себе eOD-GT8 не приведет к такому результату, но исследование IAVI G003 предоставит данные о его безопасности и иммуногенности у здоровых взрослых, проживающих в регионе, наиболее сильно пораженном ВИЧ. В исследовании примут участие 18 ВИЧ-отрицательных добровольцев. Все участники получат две дозы мРНК-вакцины и полгода будут находиться под наблюдением.

Недавние итоги клинического исследования IAVI G001 показали, что вакцинация 60-мером белка eOD-GT8 безопасна и вызывает целевые иммунные ответы у 97% реципиентов (здоровых взрослых в США). Исследование IAVI G003 должно подтвердить аналогичный эффект в африканских популяциях.

Международная группа исследователей обнаружила в пещере на территории Лаоса зуб, который, возможно, принадлежал денисовцу. Костные останки этих древних людей ранее находили только в пещерах северной части Азии, прежде всего в Сибири. Коренной зуб находился в слое возрастом 131–164 000 лет — до того, как в регионе появились люди современного типа, отмечает Nature News.

Палеопротеомный анализ показал, что зуб принадлежал представителю рода Homo, а морфологический анализ исключил принадлежность H. floresiensis, H. luzonensis и H. sapiens. Вероятно, это зуб девушки (корень не полностью развит, а в эмали отсутствуют пептиды, ассоциированных с E-хромосомой). Морфология указывает на сочетание черт неандертальца и H. erectus, а также на сходство с зубами «денисовской челюсти» из Тибета. Если анализ ДНК подтвердит денисовское происхождение зуба, это будет вторая находка окаменелости денисовца за пределами Сибири.

«Это демонстрирует, что денисовцы, вероятно, жили также в Южной Азии. И это подтверждает результаты генетиков, которые говорят о том, что современные люди и денисовцы могли встретиться в Юго-Восточной Азии», — сказал автор исследования Клеман Занолли из Французского национального центра научных исследований и Университета Бордо. Миллионы современных людей из Азии, Океании и с островов Тихого океана несут следы денисовской ДНК в своих геномах.