Коротко

Весной 2023 года компания Myriad Genetics начнет размещать в открытой базе данных ClinVar варианты, детектируемые ее тестами для оценки рисков наследственных раков, включая варианты в генах BRCA1 и BRCA2. Компания давно подвергалась критике за использование своих патентов на гены BRCA1/2 даже после решения Верховного суда США о том, что нельзя патентовать встречающиеся в природе последовательности ДНК. Решение о смене политики исходит в первую очередь от генерального директора Пола Диаза, нанятого в 2020 году.

С момента своего основания Myriad Genetics протестировала риски развития раков у более 2 млн человек. До этого момента она не делилась выявленными вариантами или информацией об их патогенности и благодаря этому сохраняла монополию на интерпретацию. Однако в последние месяцы Myriad Genetics начала менять свою политику, чтобы лучше взаимодействовать с медицинским сообществом. Всего компания планирует предоставить тысячи вариантов в BRCA1/2 и в 46 других генах, ассоциированных с 11 наследственными раками.

Ученые из Университета Оклахомы, Массачусетского университета в Амхерсте и других исследовательских центров США объединились для разработки новых методов сканирования донорских почек и оценки их качества. Оптическая когерентная томография (ОКТ) и алгоритмы машинного обучения значительно сократят время исследования трансплантата, при этом объем информации о его жизнеспособности существенно увеличится.

Обычно о качестве донорских органов судят по результатам биопсии до трансплантации и клиническим исследованиям после. Новый метод неинвазивной визуализации позволяет сканировать весь орган. Данные, напрямую поступающие с устройства ОКТ, анализирует искусственный интеллект, результаты анализа получает хирург-трансплантолог, которому останется лишь оценить, подходит ли почка для пациента.

Планируется в течение следующих четырех лет просканировать 200 донорских почек параллельно со стандартным гистологическим анализом. Органы, признанные пригодными для трансплантации, будут добавлены в систему United Network for Organ Sharing — единую сеть по закупке и трансплантации органов в США. Результаты биопсии и ОКТ-изображения почек, признанных нежизнеспособными, будут объединены в базу данных для разработки алгоритмов обработки изображений. Проект также предусматривает разработку роботизированного автоматического 3D-сканирующего ОКТ-устройства для визуализации почек перед трансплантацией.

Премия имени Г.А.Гамова в 2022 году присуждена Александре Жернаковой, профессору Университета Гронингена (Нидерланды), «за исследования кишечного микробиома и вириома как фактора старения и развития заболеваний», и Игорю Алабугину, профессору Университета штата Флорида, «за развитие тонкого органического синтеза». Награждение пройдет 19 ноября на Конференции RASA-America в Университете Ла Верн (Калифорния).

Александра Жернакова — один из основателей Groningen Microbiome Hub — возглавляет несколько крупных проектов, изучающих динамику и эволюцию кишечных бактерий и вирусов в популяционных когортах взрослых (Lifelines) и детей (Lifelines-NEXT). «Быть лауреатом премии Гамова — с одной стороны, отражение важности темы, над которой мы работаем, а с другой, большая ответственность, особенно сейчас, и повод задуматься о поддержке русскоязычных ученых и студентов», — говорит Александра Жернакова.

Игорь Алабугин занимается поиском новых связей между структурой и реактивностью соединений для создания сложных молекул с необычными свойствами. В частности, группа Алабугина разработала новые противоопухолевые препараты, действие которых основано на светоактивируемом расщеплении ДНК в раковых клетках. Кроме того, реакции, открытые в лаборатории, используются для получения сложных полициклических структур с возможным применением в молекулярной электронике. «Создание и сохранение общего культурного пространства особенно ценно во времена, когда политика разделяет. Эта награда также является для меня поводом усерднее работать над поддержкой российских студентов и молодых ученых. Крайне важно держать каналы связи открытыми, чтобы мы могли сохранить их таланты», — сказал Игорь Алабугин.

Премия учреждена Российско-американской ассоциацией ученых (RASA-America, Russian-American Science Association) в память о Георгии Антоновиче Гамове (1904–1968), выдающемся советском и американском физике-теоретике, астрофизике и популяризаторе науки. В прошлом году ее лауреатами стали филолог Марк Липовецкий и биохимик Вадим Гладышев.

Ученые из США оценили локальный ответ слизистой оболочки носа на респираторно-синцитиальный вирус у младенцев. С помощью РНК-секвенирования они проанализировали 33 назальных соскоба от младенцев, госпитализированных в ОРИТ с критическим бронхиолитом, вызванным РСВ. Все пациенты нуждались в поддержке дыхания. Ученые сравнили экспрессию генов у детей, которые находились на неинвазивной респираторной поддержке не более трех дней, более трех дней и детей, которым требовалась инвазивная вентиляция легких. Оказалось, что с продолжительностью госпитализации положительно коррелирует экспрессия генов реснитчатых клеток и их обилие. Для детей, находившихся на респираторной поддержке непродолжительное время, была характерна сигнатура базальных клеток. В группе инвазивной ИВЛ была повышена экспрессия генов, вовлеченных в активацию нейтрофилов и клеточную гибель.

Авторы отмечают, что на момент взятия соскоба клинических различий между детьми, которым в итоге потребовалась кратковременная и длительная НИВЛ, не было. При этом экспрессия генов реснитчатых клеток у этих двух групп явно различалась, что делает ее потенциальным биомаркером для предсказания продолжительности болезни. Полученные результаты требуют валидации на когорте большего размера.

В прогрессировании бокового амиотрофического склероза (БАС), обычно очень быстром, важную роль играет иммунная система, и в некоторых случаях иммунотерапия приводит к улучшению. Немецкий центр нейродегенеративных заболеваний, клиника Шарите в Берлине и Университетская больница Бонна начинают тестирование ритуксимаба — противоопухолевого препарата на основе моноклонального антитела — в группе пациентов с БАС.

У пациентов с БАС в спинномозговой жидкости могут присутствовать антитела к нейронам и В-клетки, продуцирующие антитела. Ритуксимаб вызывает истощение В-клеток, взаимодействуя с рецептором CD20 на их поверхности.

«Изменения в иммунной системе, вероятно, являются единственной причиной БАС только в очень редких случаях», — говорит координатор исследования доктор Роза Рёсслинг. Результатом, скорее всего, будет не излечение от болезни, а замедление ее развития, но и это было бы значительным достижением.

В исследовании принимают участие 52 человека со спорадической формой БАС, у которых заболевание началось не более года назад. Половина получит ритуксимаб, другая половина — плацебо. Исследование продлится более года: первые две дозы участники получат с интервалом в две недели, затем третью и четвертую дозу с интервалами в шесть месяцев.

Антимонопольные органы Европейского Союза предписали компании Illumina сохранить разработчика тестов для раннего выявления рака Grail в качестве отдельной организации вплоть до выхода отдельного приказа о прекращении слияния.

Illumina заявила, что планирует приобрести Grail, еще в 2020 году. Временный приказ, срок действия которого истек в конце октября, был издан европейским органом по защите конкуренции еще в прошлом году — сразу после того, как Illumina приобрела Grail, не получив предварительно соответствующих разрешений от европейских антимонопольных регуляторов. Шестого сентября 2022 года ЕС наложил вето на сделку, чтобы сохранить конкуренцию на развивающемся рынке.

«Европейская комиссия обновила и скорректировала в соответствии с регламентом ЕС о слияниях временные меры, которые гарантируют, что Illumina и Grail останутся отдельными компаниями после решения Комиссии заблокировать слияние», — говорится в заявлении наблюдательного органа ЕС.

Grail должна управляться независимыми менеджерами исключительно в своих интересах; сотрудники и топ-менеджмент Grail не могут делиться конфиденциальной информацией с Illumina. При этом Illumina должна будет предоставить Grail средства на разработку новых тестов для выявления рака.

Невыполнение требований приведет к выплате штрафа в размере до 5% от среднего дневного оборота Illumina.

Компания Roche выводит на рынок новую систему для молекулярной диагностики Cobas 5800 — компактный полностью автоматизированный лабораторный инструмент для проведения ПЦР-тестирования на инфекционные заболевания. Компания получила допродажное одобрение Управления по контролю продуктов и лекарств США (FDA) диагностики на Cobas 5800, а также на тест для выявления ВИЧ-1 — первый в семействе анализов Cobas x800, доступный для использования в системе cobas 5800

Cobas 5800 позволяет получить до 144 результатов за восемь часов, сообщает Roche. Автоматизированы перенос и подготовка проб, амплификация, определение результатов и их выгрузка в информационную систему лаборатории. Новая система и тест появятся на рынке уже в четвертом квартале 2022 года.

В январе 2022 года человеку впервые трансплантировали сердце генно-модифицированной свиньи. Больной прожил 61 день. Исследователи занялись поиском причин, приведших к смерти. Поскольку признаков отторжения и заражения обнаружено не было, ученые предположили, что причиной остановки сердца стало нарушение сердечного ритма.

Действительно, анализ ЭКГ пациента, которую после операции делали ежедневно, выявил значительные изменения в электропроводимости сердца. Пока оно находилось в теле свиньи, интервалы PR, QRS и QT на ЭКГ были короткие (50–120, 70–90 и 260–380 миллисекунд соответственно), а после пересадки удлинились до 190, 138 и 538 миллисекунд. Самым опасным считается увеличение интервала QT, что связано с повышенным риском фатального нарушения сердечного ритма.

Полностью результаты исследования будут представлены на научной сессии Американской кардиологической ассоциации в Чикаго 5–7 ноября.

Исследователи из Китая использовали искусственный интеллект (ИИ) для идентификации соединений, которые могли бы нейтрализовать активные формы кислорода (АФК), вызывающие облысение. Отобрав лучшее соединение, они нанесли его на пластырь с микроиглами и восстановили волосяной покров мыши. Это вещество было нанозимом — мимиком супероксиддисмутазы (СОД).

Всего была протестирована 91 комбинация переходных металлов, фосфатов и сульфатов. ИИ показал, что тиофосфит марганца MnPS₃ лучше всего будет имитировать СОД. Действительно, вещество снижало уровень АФК в человеческих фибробластах кожи, не повреждая их. После этого MnPS₃ нанесли на пластырь с микроиглами и опробовали на мышиной модели андрогенетической алопеции. Через 13 дней шерсть на спинках мышей росла гуще и толще, чем после применения тестостерона или миноксидила.

Французская биотехнологическая компания Spikimm, созданная совместно с Truffle Capital и Институтом Пастера в Париже для разработки эффективного лечения COVID-19, получила международную лицензию на моноклональные антитела широкого спектра действия, нацеленные на S-белок SARS-CoV2, включая субварианты омикрона.

Два антитела, SPK001 и SPK002, которые разработаны в лаборатории иммунологии человека Института Пастера, показали высокую нейтрализующую активность в испытаниях in vivo (на грызунах). В клинических исследования фазы 1 новые антитела были протестированы на трех группах здоровых добровольцев. В настоящее время начинаются клинические испытания фазы 2 на четырех группах пациентов с иммунодефицитом, который может быть связан с трансплантацией органов, гематологическим раком или аутоиммунными заболеваниями. Такие люди (во Франции их около 300 000, в Европе и США — 10 миллионов) особенно нуждаются в специфичной защите, поскольку COVID-19 у них зачастую протекает в тяжелой форме и приводит к смерти.

В зависимости от результатов клинических испытаний SpikImm планирует запросить разрешение на ранний доступ и экстренное использование SPK001 уже во втором квартале 2023 года.