Коротко

Компания SkyGen дарит скидку 25% на 25 эндонуклеаз рестрикции от New England Biolabs.

В акции участвуют коровые рестриктазы, рестриктазы типа IIS, ферменты, чувствительные к метилированию ДНК и High Fidelity эндонуклеазы.

Сроки проведения акции: 14 февраля — 10 марта.

Ученые из США разработали систему для определения протромбинового времени, пригодную для применения у постели больного. Система использует вибрационный мотор и камеру смартфона. Пластиковая емкость с частицами меди крепится к смартфону, в нее помещается 10 мкл крови. Затем с помощью камеры отслеживаются перемещения медных частиц в образце при работе мотора. Когда кровь сворачивается, движение частиц прекращается. Протромбиновое время рассчитывает специальный алгоритм. Систему протестировали на 140 образцах плазмы, часть из которых была получена от пациентов, проходящих лечение в связи с нарушениями свертываемости крови, и на 79 образцах крови от пациентов с коагулопатическими состояниями. В обеих случаях протромбиновое время, рассчитанное с помощью смартфона, соответствовало таковому, полученному с использованием стандартного анализатора.

В ближайшее время разработчики планируют протестировать систему в домашних условиях.

Исследователи из Канады ввели в геном клеток человека, выращенных in vitro, мутацию, обеспечивающую защиту от болезни Альцгеймера. Статья опубликована в The CRISPR Journal. Некоторые мутации увеличивают риск развития БА, но редкая мутация A673T, обнаруженная в 2012 году у населения Исландии, снижает этот риск. Амилоидные бляшки, вызывающие гибель нейронов при БА, образуются, когда белок-предшественник амилоида расщепляется ферментом бета-секретазой. «Исландская» мутация в гене белка-предшественника затрудняет расщепление. Для редактирования использовали модификацию CRISPR — prime editing. В итоге до 68,9% копий гена содержали защитную мутацию.

Подобная генная терапия, по мнению авторов, могла бы предотвратить развитие БА у людей с наследственной формой заболевания. Правда, «теперь задача состоит в том, чтобы найти способ отредактировать геном миллионов клеток мозга», сказал руководитель работы Жак Трембле.

Согласно результатам клинического исследования, опубликованного в JAMA Network Open, противопаразитарный препарат никлозамид не ускоряет клиренс SARS-CoV-2 из ротоглотки. В исследовании приняли участие 73 взрослых пациента с легкой или умеренной формой COVID-19. Они были распределены в группы никлозамида или плацебо и принимали препарат перорально в течение семи дней. На 3, 7, 10 и 14 дни у пациентов брали орофарингеальные мазки и образцы стула. В образцах определяли РНК SARS-CoV-2 с помощью ОТ-ПЦР и по ее наличию делали вывод о заразности пациента.

На третий день не было значимой разницы в содержании вируса в образцах от пациентов из групп препарата и плацебо. По мнению авторов, результаты необходимо подтвердить на большей выборке.

Возрождение вымерших видов, таких как мамонты, порождает множество вопросов. Один из них — можно ли будет их запатентовать? Журнал Wired отмечает, что OncoMouse (мышь, склонная к развитию рака) была запатентована, но овечка Долли — нет, так как являлась копией существующего организма. Заявленная цель исследователей — вернуть нам потерянные виды, и вероятно, запатентовать их будет нельзя. С другой стороны, многие проекты планируют получить похожих, но все же не совсем идентичных животных. Так, мамонт скорее будет похож на шерстистого морозоустойчивого слона. И этой разницы может хватить, чтобы патент одобрили.

Конечно, остается вопрос: нужно ли вообще пробовать патентовать возвращенные на Землю организмы? Так, Бэн Новак из проекта Revive & Restore высказал мнение, что «высокомерно» думать, что человек может иметь какие-то законные права на целую популяцию живых существ.

Мониторинг сточных вод — один из способов оценки распространения SARS-CoV-2. Ученые из Ратгерского университета (США) проверили, влияют ли микробные биопленки, образующиеся на поверхности канализационных труб, на концентрацию вирусной РНК в сточных водах. Они сконструировали кольцевой биореактор со съемными пластинами из поливинилхлорида. Через реактор пропускали неочищенные сточные воды, в результате чего на поверхности пластин оседало твердое вещество и формировались биопленки. Ученые провели два эксперимента длительностью 28 дней каждый. Первый эксперимент пришелся на период низкой заболеваемости COVID-19 в регионе (август-сентябрь 2020 г.), второй — на период высокой заболеваемости (ноябрь-декабрь 2020 г.). Полимерные пластины периодически изымали из реактора и оценивали содержание РНК SARS-CoV-2 в покрывающих их биопленках.

В первом эксперименте количество вирусной РНК было низким и в биопленках, и в окружающих сточных водах. Во втором эксперименте уровень вирусной РНК все еще был низким в воде, но в биопленках он повысился. В период высокой заболеваемости биопленки накопили около 700 копий вирусных геномов на см²; этот показатель коррелировал с кумулятивным числом случаев COVID-19 в регионе. Результаты говорят о том, что канализационные биопленки могут удерживать РНК SARS-CoV-2. По мнению авторов, этот факт стоит учитывать при интерпретации результатов анализа сточных вод.

Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) опубликовали данные по эффективности разных типов лицевых масок в закрытых общественных местах. Специалисты CDC собирали информацию о том, какие маски носили жители Калифорнии, получившие положительный ПЦР-тест на коронавирус в период с февраля по декабрь 2021 г. Итоговый отчет составлен по ответам 534 респондентов. По результатам статистического анализа респиратор типа N95/KN95 снижает риск заражения в помещении на 83%, хирургическая маска — на 66%, тканевая маска — на 56%. Специалисты отмечают, что при выборе средств защиты органов дыхания важно обращать внимание не только на тип маски или респиратора, но также на их комфортность и возможность правильно их подогнать.

Ведущий корреспондент Science Джон Коэн проводит параллель между вариантом омикрон коронавируса SARS-CoV-2 и коронавирусом свиней, который произошел от более опасного вируса и создал иммунитет к нему.

Вирус трансмиссивного гастроэнтерита свиней (TGEV), убивающий животных, распространился по миру в 1970-х годах, но затем практически исчез. Ситуация выглядела загадочной: у поросят были антитела к TGEV, но они не страдали от диареи и рвоты. Оказалось, что они инфицированы родственным вирусом, который атаковал не ЖКТ, а трахеи, бронхи и легкие. Его назвали респираторным коронавирусом свиней ( PRCV). Интересно, что в Соединенных Штатах PRCV появился позже, чем в Европе, и его генетическая последовательность отличалась, как если бы он возник в США независимо. Будучи респираторным, он распространялся намного быстрее «прародителя». Возникла версия о «лабораторном» происхождении PRCV — якобы он произошел от мутировавшего вакцинного вируса, но затем оказалось, что он имеет больше общего с природным TGEV.

Сам Коэн называет параллель «провокационной, но не идеальной». Омикрон может вызвать тяжелые заболевания, кроме того, неочевидно, что иммунитет против омикрона будет защищать от других вариантов. TGEV и PRCV в итоге рекомбинировали в новый вариант, который доминирует на фермах США, распространяется легко и не вызывает тяжелых заболеваний. Однако нельзя предвидеть, сможет ли омикрон так же «приручить», например, дельту, или рекомбинация создаст более опасный штамм.

Международная команда ученых сравнила стоимость предотвращения пандемии с убытками, которые приносит уже случившаяся пандемия. Статья опубликована в Science Advances. Авторы не согласны с позицией политиков, которые продвигают стратегию «выявления и сдерживания зоонозных угроз», так как она предполагает активные действия после того, как заболеют люди. По их оценкам, ожидаемая ежегодная смертность от зоонозных инфекций составляет 3,3 млн. человек. Стоимость этих жизней составляет не менее $350 млрд., а прямые экономические потери — еще $212 млрд. Ученые отмечают, что политики редко говорят о том, какие действия нужно предпринять для предотвращения перехода зоонозного заболевания из природного резервуара в человеческую популяцию. Однако такие действия обойдутся гораздо дешевле.

В статье приведены рекомендации по предотвращению пандемии. Среди них более пристальное изучение потенциальных патогенов человека, более тщательное отслеживание торговли дикими животными и охоты; сокращение вырубки лесов. По расчетам авторов, стоимость этих мер в сумме составляет около $20 млрд., что гораздо меньше стоимости унесенных инфекциями жизней.

Вебинар «Омикрон в России и в мире: эпидемиология, диагностика и особенности клинического течения» прошел 1 февраля 2022 года. Ведущие эксперты рассказали об особенностях распространения омикрона и других вызывающих обеспокоенность вариантов SARS-CoV-2, специфике эпидемиологического мониторинга и молекулярной диагностики инфекций при одновременной циркуляции различных генетических линий коронавируса на территории страны.

Запись вебинара выложена на YouTube-канале портала PCR.NEWS.