Меню
Все темы
Ученые из США проверили, влияют ли на иммунологическую эффективность мРНК-вакцин против COVID-19 симптомы, проявляющиеся после вакцинации. Исследование проводилось на когорте из 954 работников здравоохранения, привитых препаратами Pfizer/BioNTech или Moderna. Участникам предложили заполнить опросник и взяли у них образцы крови через 14 или более дней после второй дозы. Клинически значимыми считались такие симптомы, как утомляемость, жар и озноб. Они развились у 52 участников после первой дозы и у 407 после второй дозы. Предшествующая коронавирусная инфекция (положительный ПЦР-тест не позднее чем через 14 дней после второй дозы или определенное значение IgG к S-белку перед вакцинацией) ассоциировалась с повышенной вероятностью клинически значимых симптомов после первой дозы, но не после второй. IgG к S-белку выработались у 953 из 954 участников независимо от реакции на прививку. Единственный участник, у которого антител не обнаружилось, принимал иммунодепрессанты. Таким образом, ни сила реакции на прививку, ни предшествующая коронавирусная инфекция не влияют на выработку антител в ответ на мРНК-вакцины.
Ученые из Австралии сравнили три популярных протокола для полногеномного секвенирования SARS-CoV-2 в образцах с низкой вирусной нагрузкой. Оценивали чувствительность, специфичность и способность детектировать варианты, встречающиеся с низкой частотой. Результаты опубликованы в журнале Journal of Clinical Microbiology.
Авторы сравнили протоколы ARTIC v3, Respiratory Virus Oligo Panel (RVOP) и long-amp (pooled long-amplicon method). Секвенировали семь клинических образцов при серийном разведении. RVOP и long-amp хуже работают при низких вирусных нагрузках и низком качестве РНК, чем ARTIC v3. Чувствительность и покрытие ARTIC v3 можно повысить, модифицируя протокол. RVOP детектировал больше всего низкочастотных вариантов, однако некоторые из них оказались артефактами.
Авторы заключают, что ARTIC v3 — самый чувствительный и эффективный с точки зрения затрат протокол. Он лучше подходит для выявления вариантов, встречающихся с низкой частотой и для работы с образцами с низкой вирусной нагрузкой.
Компания SkyGen отправила подарки всем призерам викторины по нанопоровому секвенированию. Поздравляем! Делитесь фотографиями подарков и впечатлениями в соцсетях, не забывайте отмечать аккаунт SkyGen:
Ученые из Саудовской Аравии и США проанализировали 810 случайных статей, в которых исследования проводились на клетках млекопитающих. Многие из них не включают важные данные об условиях культивирования. Около половины изученных статей не сообщают о температуре и уровне CO2 в инкубаторе, менее 10% приводят данные об уровне кислорода в инкубаторе и менее 0,01% — о кислотности среды. Об уровнях кислорода и углекислого газа в среде не написал никто. Работа опубликована в журнале Nature Biomedical Engineering.
Клетки растут в инкубаторах с контролируемыми стандартными условиями. Однако между клетками и их окружением происходит газообмен, что может повлиять на кислотность и концентрации растворенных кислорода и углекислого газа. Эти изменения, в свою очередь, могут повлиять на клеточные процессы. Среда может сильно отличается от тех условий, в которых клетки растут in vivo.
Авторы рекомендуют стандартизировать процессы контроля среды, процедур измерений и публикации этих данных. Это повысит воспроизводимость результатов, полученных на культурах клеток млекопитающих.
В пятницу, 13 августа, компания Moderna объявила об одобренииFDA третьей дозы вакцины mRNA-1273 для взрослых реципиентов солидных органов или индивидов с диагнозом, предполагающим такой же уровень иммунокомпрометированности. Риск тяжелой формы COVID-19 для этой группы пациентов очень высок, поэтому им необходима особая схема вакцинации. В рандомизированных клинических испытаниях с участием 120 реципиентов солидных органов было показано, что третья доза mRNA-1273 усиливает иммунный ответ и в целом переносится хорошо.
Похожие результаты были получены ранее учеными из США на меньшей выборке.
Are you interested in cryo-EM and membrane proteins? WE ARE HIRING! Opening for a PhD position to work on the structure and function of human lipid transporters at VIB-VUB Center for Structural Biology in Brussels, Belgium.
What we offer VIB is an excellence-based entrepreneurial institute that focuses on translating basic scientific results into pharmaceutical, agricultural and industrial applications. VIB Center for Structural Biology Brussels is associated to the Vrije Universiteit Brussel (VUB) and houses research groups with a strong expertise in protein biochemistry, biophysics, nanobody technology, X-ray crystallography, NMR and electron microscopy.
Our group is interested in the structure and function of mammalian lipid transporters and in the membrane biology of the cell. In another line of research, we study the biophysics of ion channels of the endomembrane system and their role in neurodegenerative or neurological diseases such as Parkinson Disease. To advance our understanding in these fields we combine functional characterization (liposomal and cellular assays, fluorescence microscopy, electrophysiology) with a structural description of the involved proteins using cryo-EM and X-ray crystallography. Further details on available topics will be discussed during the interviews.
You will have access to state-of-the-art research facilities such as the VIB-VUB facility for Bio Electron Cryogenic Microscopy equipped with a 300 kV JEOL cryoARM300 electron microscope and K3 detector as well as the VIB Nanobody Core.
PhD students will have access to an extensive scientific and transferable skills training programs available through our affiliated institutes.
Start of the PhD student position can be negotiated, but ideally October or November 2021.
PhD students are further encouraged to apply for an FWO-fellowship to acquire their own funding (call deadline March 2022). Candidates will be assisted for the funding application.
Your profile
You are an enthusiastic, highly motivated and curiosity-driven personality with a strong background in biochemistry/biology/biotechnology and an interest in membrane proteins and organelle biology. Independent and critical thinking and good organizational skills are a prerequisite. You hold a university degree in biochemistry/biology or in a related discipline. Hands-on experience with either protein purification, cryo-EM or mammalian cell culture is required.
More information on the lab available at: vib.be/labs/brunner-lab
Motivated candidates are asked to apply online: vib.be/labs/brunner-lab
В группе телеграм-чатов независимых исследователей вакцин против коронавируса опубликованы предварительные результаты для вакцины «КовиВак», разработанной в Центре имени М.П. Чумакова. Иммунологическая эффективность оценена на основании 230 отзывов об определении антител IgG к белкам коронавируса с помощью коммерческих тест-систем; в этой группе сероконверсия (доля имеющих антитела) после 35 дня от первой дозы) не превышает 45%.
Одна из аккредитованных испытателями лабораторий определила вируснейтрализующую активность сывороток десяти вакцинированных. По результатам можно предположить, что сыворотки нейтрализуют штамм дельта, хотя и немного хуже, чем «уханьский», и что нейтрализующая активность коррелирует с содержанием антител к S-белку. У двоих вакцинированных без антител наблюдались признаки формирования Т-клеточного иммунитета.
Режим вакцинации «КовиВак-Спутник V» (11 отчетов) показал высокую иммунологическую эффективность, сопоставимую с вакцинацией «Спутником» переболевших. Авторы отчета предполагают, что В-клетки памяти формируются после вакцинацией «КовиВаком» даже при отсутствии детектируемых антител, и после бустерной дозы «Спутника» развивается вторичный иммунный ответ.
Авторы подчеркивают, что эти данные являются промежуточными и что иммунологическая эффективность может не отражать реальной эпидемиологической эффективности вакцины «КовиВак», которая будет определена в фазе 3 клинических исследований.
Итальянские ученые провели лонгитюдное исследование госпитализированных и амбулаторных пациентов, выздоровевших послеCOVID-19. Антитела определяли ежемесячно в течение первых 4 месяцев, а затем через 6, 8 и 10 месяцев после начала заболевания. Участвовало 542 человека (289 женщин, средний возраст 53,1 года), в основном с легкой формой COVID-19 (370, 68,3%).
В первые два месяца иммуноглобулины G (IgG) появились у 90%. Через 10 месяцев исчезновение IgG наблюдалось у 47%. Независимыми предикторами долгосрочного иммунитета были пожилой возраст, количество симптомов в остром начале, тяжесть острого COVID-19.
В понедельник, 9 августа, компания Bluebird Bio объявила о приостановке программы по разработке и внедрению в клинику лентивирусной терапии церебральной адренолейкодистрофии. Это произошло из-за сообщения о развитии миелодиспластического синдрома у одного из участников фазы 3 клинических испытаний, получившего лентивирусный препарат Lenti-D (эливальдоген аутотемцел) больше года назад. Компания отмечает, что особенности дизайна лентивирусного вектора могли привести к его инсерции, которая и стала причиной заболевания. Приостановка программы Lenti-D не должна повлиять на другие проекты Bluebird Bio, нацеленные на серповидноклеточную анемию, бета-талассемию и онкозаболевания.
В феврале этого года на паузу были поставлены клинические испытания лентивирусного препарата bb1111 против серповидноклеточной анемии из-за острого миелоидного лейкоза у пациента. Однако уже в марте компания объявила, что связь ОМЛ с bb111 маловероятна.
Ученые проанализировали данные пациентов с COVID-19 в 314 госпиталях Великобритании, заболевших до 1 августа 2020 года. По крайне мере 11,1% заразились после госпитализации. К середине мая этот показатель составил 16–20%, это было после пика случаев госпитализации первой волны.
Авторы говорят, что 5 699–11 862 пациента заразились уже после поступления в больницу. Скорее всего эта цифра даже больше, ведь часть пациентов заразилась в больнице и выписалась до постановки диагноза.
Среди причин называют большой наплыв пациентов и недостаток места для их изоляции, отсутствие доступа к средствам быстрой и надежной диагностики, а также дефицит средств индивидуальной защиты. В начале пандемии было неизвестно, когда пациент наиболее заразен, не были описаны многие атипичные симптомы, а риски передачи коронавируса по воздуху зачастую недооценивались. Авторы исследования говорят, что в настоящее время риск заразиться в больнице намного ниже.
