Коротко

На прошлой неделе в npj Genomic Medicine вышел обзор фармакогеномных ассоциаций препаратов, рекомендованных для терапии COVID-19. Авторы проанализировали публикации на PubMed, базу PharmGKB, рекомендации Консорциума по внедрению клинической фармакогенетики и FDA, а также таблицу фармкакогенетических ассоциаций FDA. В обзоре собрана информация о гидроксихлорохине, хлорохине, азитромицине, ремдесивире, фавипиравире, рибавирине, лопинавире/ритонавире, дарунавире/кобицистате, интерфероне бета-1b, тоцилизумабе, руксолитинибе, барицитинибе и кортикостероидах. Ученые обнаружили, что некоторые генные варианты влияют на фармакокинетику препаратов. Кроме того, были найдены ассоциации вариантов генов с побочными эффектами для противомалярийных препаратов (G6PD; гемолиз), рибавирина (ITPA; гемолиз) и интерферона бета-1b (IRF6; гепатотоксичность). Таким образом, в обзоре названы потенциальные генетические маркеры для индивидуального подбора терапии при COVID-19. Внедрить эти маркеры в клиническую практику можно будет после оценки их значимости в клинических исследованиях.

Вариант нового корронавируса Δ382 — с делецией (потерей) 382 нуклеотидов в геноме — был обнаружен в Сингапуре в январе и феврале 2020 года. Эта делеция обрезает открытую рамку считывания (ORF) 7b и удаляет последовательность, регулирующую транскрипцию ORF8, в результате транскрипция ORF8 отсутствует. Вариант Δ382 успешно распространялся на ранних этапах эпидемии, но не был обнаружен после марта 2020 года.

В The Lancet опубликованы результаты исследования, которое показало связь между вариантом Δ382 и более легким течением заболевания. 278 пациентов с подтвержденной методом ПЦР инфекцией SARS-CoV-2 были проверены на делецию ∆382, 131 человек включили в исследование. Из них 92 были инфицированы вирусом дикого типа, десять имели смесь вирусов дикого типа и ∆382-варианта, а 29 — только ∆382-вариант. Гипоксия, требующая кислородной поддержки, не развилась ни у одного из пациентов в группе ∆382, а в группе дикого типа — у 26 из 92.

Генеральный директор ВОЗ Тедрос Аданом Гебреисус сообщил, что с Глобальным фондом вакцин COVAX (это одна из ветвей проекта ВОЗ Act-Accelerator) на сегодняшний день сотрудничают 172 страны. В настоящее время портфель фонда включает девять вакцин; ведутся переговоры с четырьмя производителями, и еще девять вакцин в настоящее время проходят оценку.

COVAX, говорит Тедрос Аданом Гебреисус, станет важнейшим механизмом для закупок и объединения рисков, его задача — обеспечить для всех стран, входящих в Фонд, доступ к любой вакцине, которая покажет себя безопасной и эффективной. «Это отвечает интересам всех стран, даже тех, которые самостоятельно инвестировали в отдельных производителей. (…) Это не только объединяет риски, это также означает, что цены будут поддерживаться на минимально возможном уровне».

Помимо ВОЗ, в проекте участвуют Глобальный альянс по вакцинам и иммунизации (GAVI) и Коалиция за инновации для готовности к эпидемиям (CEPI), которая одной из первых инвестировала в разработку вакцин. Цель — создать, произвести и справедливо распределить 2 миллиарда доз безопасной и эффективной вакцины против COVID-19 к концу 2021 года, чтобы положить конец острой фазе пандемии.

Об эффективности ремдесивира против новой коронавирусной инфекции было много дискуссий (подробнее на PCR.news). Исследование ACTT Национального института аллергии и инфекционных заболеваний в итоге продемонстрировало клиническую пользу у пациентов с тяжелой формой COVID-19. Однако его эффект у пациентов с умеренной тяжестью заболевания оставался неизвестен.

В фазе 3 рандомизированного открытого исследования, которое проводила компания Gilead Sciences, разработавшей этот препарат, участвовали 584 пациента с COVID-19 средней степени тяжести. Их разделили на три группы: одна должна была получать 10-дневный курс ремдесивира (внутривенно по 200 мг в 1-й день, а затем по 100 мг/сут.); фактическая медианная продолжительность лечения в этой группе составила 6 дней; другая группа получала 5-дневный курс, третья — стандартное лечение. Все они проходили лечение в марте-апреле 2020 года. Результаты опубликованы в JAMA.

На 11-й день после начала лечения пациенты, получавшие 5-дневный курс ремдесивира, имели статистически значимо лучший статус по сравнению с контрольной группой, хотя клиническое значение этого различия было неясным. У группы, получавшей 10-дневный курс, статистически значимых отличий от контроля не было. К 14-му дню клинический статус групп обеих групп, получавших ремдесивир, значительно отличался от такового в группе стандартного лечения.

Исследователи из Федерального университета Рио-де Жанейро с коллегами предлагают использовать лошадиные гипериммунные глобулины для терапии COVID-19. Статья размещена на сервере препринтов bioRxiv. Пяти лошадям вводили подкожно в течение 6 недель рекомбинантный S-белок. У четырех из пяти животных получили сильный иммунный ответ. Сыворотки иммунизированных лошадей показали примерно в 140 раз более высокие нейтрализующие титры (тест нейтрализации редукции бляшек PRNT90) по сравнению с плазмой трех выздоравливающих пациентов с COVID-19.

Чтобы предотвратить возможные побочные эффекты, вызванные лошадиной антисывороткой, IgG обрабатывали пепсином и очищали фракционным солевым осаждением для удаления фрагментов Fc; этот процесс применяется для производства концентратов фрагментов F(ab')₂ для пассивной иммунизации против бешенства, столбняка и змеиных ядов. Высокие нейтрализующие титры против SARS-CoV-2, полученные для необработанных сывороток, были подтверждены для F(ab')₂.

Мария Ван Керкхове, технический руководитель по реагированию на COVID-19 Программы чрезвычайных ситуаций ВОЗ, сделала такое заявление в интервью The Telegraph. Она считает карантин недопустимым на данном этапе, так как его экономические, социальные и медицинские издержки были огромными.

К концу марта, когда вспышка коронавируса вышла из-под контроля по всему миру, более 100 стран ввели полную или частичную изоляцию, затронувшую миллиарды людей. Этот «грубый инструмент силы» выигрывал странам время для борьбы с COVID-19, однако в будущем ВОЗ советует перейти к более мягким мерам. «Локдауны — это не то, что рекомендовано ВОЗ, но их необходимо было использовать в ряде стран, потому что вспышки распространялись очень быстро, — сказала доктор Ван Керхове. — Но мы надеемся, что странам больше не придется вводить национальные локдауны». Доктор Ван Керкхове призвала страны применять «индивидуализированные, специфичные, локализованные» подходы для сдерживания инфекции, включая отслеживание контактов, массовое тестирование, оснащение больниц необходимым оборудованием и материалами, физическое дистанцирование и ношение масок.

Она добавила также, что не следует надеяться на скорое начало вакцинирования, поскольку необходимо обеспечить безопасность и эффективность: «В ближайшие полгода у нас не будет вакцины». — сказала Мария Ван Керкхове.

Управление по контролю продуктов и медикаментов США (FDA) опубликовало письмо, в котором информирует клинические лаборатории и медработников о двух проблемах, связанных с тестом на COVID-19 от Thermo Fisher Scientific — TaqPath COVID-19 Combo Kit. В частности, расследования жалоб клиентов показали, что неправильное встряхивание и центрифугирование планшетов для ОТ-ПЦР может привести к ложноположительным результатам. Фирма обновила инструкции по применению, чтобы снизить риск ошибок. Кроме того, программное обеспечение для интерпретации от Applied Biosystems, используемое с тестом, также необходимо обновить для получения наиболее точных отчетов.

Тест Thermo Fisher стал вторым коммерческим диагностическим тестом, разрешенным для использования в экстренной ситуации в США: он получил EUA в марте, а с апреля также разрешен в 50 других странах.

Ученые  проанализировали литературные данные о вспышках кори в США в период с 30 ноября 2015 года по 1 июня 2020 года и выяснили, что большую часть (56,8%) заболевших в этот период составили непривитые индивиды, при этом 70,6% непривитых не имели медицинского отвода. Вспышки возникают при ввозе кори из стран, в которых это заболевание остается эндемичным, затем корь непрерывно распространяется внутри США в сообществах с низким уровнем вакцинации. В настоящее время в условиях пандемии COVID-19 отмечается значительное снижение количества заказанных и израсходованных доз вакцин с коревым компонентом, и в целом чувствительность популяции к кори возрастает, что может иметь серьезные последствия для общественного здравоохранения. Ученые считают, что в сложившейся ситуации необходимо снизить число отказов от вакцинации. Среди эффективных методов авторы называют усложнение процедуры отказа, а также стратегии коммуникации и убеждения, основанные на научных фактах.

Ученые из США, Италии и Франции предположили, что препарат против гепатита C AT-527 может быть активен и против SARS-CoV-2. AT-527 — это аналог трифосфата гуанозина, который сейчас проходит клинические испытания, его переносимость и безопасность уже подтверждены. В новой работе для проверки активности препарата против коронавирусов ученые использовали другую его форму, AT-511, которая представляет собой свободное основание. В серии экспериментов на культурах клеток было показано, что AT-511 эффективно ингибирует репликацию SARS-CoV-2, SARS-CoV, а также сезонных коронавирусов HCoV-229E и HCoV-OC43 (эффективная концентрация EC₉₀ 0,34–1,2 мкМ). При этом активность препарата против MERS-CoV была на 30% ниже, что, по словам авторов, свидетельствует об уникальном механизме действия препарата.

Китайские ученые создали микроробота для биопечати in situ in vivo, с помощью которого в перспективе можно будет лечить повреждения стенки желудка. Микроробот может быть доставлен в желудок с помощью эндоскопа. Проверку концепции проводили in vitro на модели желудка. В качестве биочернил использовали желатин-альгинатный гель с человеческими клетками желудочного эпителия и клетки гладкой мускулатуры желудка. Напечатанные микророботом клеточные структуры были достаточно прочными и сохраняли жизнеспособность при культивировании в течение 10 дней. По словам авторов, это первая работа в рамках концепции биопечати in situ in vivo, и ее можно считать прогрессивной не только в области биопечати, но и в области медицинских наук.