Коротко

Репликация коронавирусов ассоциирована с цитозольными двухмембранными везикулами, которые обеспечивают подходящую микросреду для синтеза вирусной РНК в инфицированной клетке. Однако до сих пор было неясно, как мРНК вируса попадает из этих везикул в цитозоль для трансляции и сборки новых вирионов. Ученые из Нидерландов, Германии и США нашли ответ на этот вопрос и рассказали о своей работе в Science. Для экспериментов они использовали хорошо изученный модельный коронавирус MHV. С помощью криоэлектронной микроскопии ученые визуализировали молекулярную пору, пронизывающую обе мембраны везикулы. Через эту пору, скорее всего, и происходит экспорт РНК в цитозоль. В основе поры лежит гексамер большого коронавирусного трансмембранного белка nsp3. Функциональные особенности поры еще предстоит изучить, однако авторы считают, что эта структура играет ключевую роль в цикле вирусной репликации и консервативна у коронавирусов, а потому может рассматриваться в качестве мишени для противовирусных препаратов.

Ученые из Канады и Великобритании создали SeroTracker — онлайн-агрегатор результатов серологических исследований, связанных с SARS-CoV-2, и рассказали об этом в The Lancet Infectious Disease. Ресурс позволяет визуализировать серопревалентность в разных странах и сравнивать показатели по регионам, популяциям и особенностям использованных тестов. Ежедневно команда докторантов и студентов-медиков анализирует опубликованные статьи, препринты и правительственные отчеты, посвященные сероэпидемиологии COVID-19. Для SeroTracker из текстов берутся не только показатели серопревалентности, но и данные о размере выборки, подходе к сбору образцов и использованных тест-системах. Код SeroTracker доступен на GitHub.

Ученые из Финляндии провели метаанализ пяти рандомизированных контролируемых исследований, в которых проверялось, как влияет ношение масок, в том числе сделанных из обычной ткани, на передачу вирусных респираторных инфекций в общественных местах (вне больниц и мест проживания). Препринт их статьи размещен на medRxiv. Наблюдалось статистически значимое снижение числа инфекций, причем авторы сделали вывод, что маски защищают «как владельца, так и окружающих его людей». Они призывают руководителей стран и ВОЗ активнее рекомендовать масочный режим.

Авторы еще одного исследования, также опубликованного на medRxiv, проанализировали влияние на последующую смертность обязательных мер, введенных государственными органами во время пандемии, добровольного изменения поведения до введения нормативных актов. Использовали данные из 13 западноевропейских стран. Эффекты оказались сравнимыми по порядку величин.

Ученые применили экологический подход для описания ситуации с COVID-19 в Перу. Они обнаружили, что в равнинных областях (побережье Тихого океана и Амазонская низменность) уровень заболеваемости и частота смертей выше, чем в горном регионе. Дальнейший анализ показал, что относительный риск COVID-19 значительно выше для людей, обитающих на высоте ниже 1 000 м над уровнем моря, чем для жителей областей выше этой отметки. Защитный эффект большой высоты проявлялся независимо от плотности популяции и показателей благосостояния населения. Авторы предполагают, что риск смерти от COVID-19 снижен для жителей горных регионов благодаря длительной мультисистемной адаптации организма к гипобарическим гипоксийным условиям. Работа доступна в базе препринтов medRxiv.

Вакцина компании Novavax, согласно трекеру ВОЗ, первой среди субъединичных вакцин вошла в клинические испытания. (Сейчас в этом списке уже шесть вакцин, содержащих вирусный белок или его фрагмент, которые находятся в фазе 1 или 1/2.) Вакцина NVX-CoV2373 содержит полноразмерный рекомбинантный S-белок коронавируса и запатентованный компанией адъювант. Как сообщается в пресс-релизе, результаты части 1 фазы 1/2 размещены на сервере препринтов medRxiv, а также отправлены в рецензируемый журнал. Уже опубликованы в виде препринта результаты преклинических исследований на павианах и мышах. В исследовании участвовал 131 здоровый человек в возрасте 18–59 лет. У 100% участников образовались нейтрализующие антитела, адъювант вызвал полифункциональный CD4+T-клеточный ответ.

В базе препринтов bioRxiv появились результаты проверки эффективности комбинации нейтрализующих моноклональных антител REGN-COV2 против SARS-CoV-2 на макаках-резусах и сирийских хомячках. REGN-COV2 включает антитела REGN10987 и REGN10933, разработанные компанией Regeneron Pharmaceuticals. Было показано, что REGN-COV2 обладает выраженными профилактическими и терапевтическими свойствами: у животных, получавших антитела, вирусная нагрузка была ниже, а проявления инфекции — менее выраженными по сравнению с плацебо-группами. Ранее было показано, что аминокислотная замена D614G в S-белке SARS-CoV-2 не влияет на нейтрализующую способность антител REGN10987 и REGN10933. В настоящее время проходят клинические исследования комбинации REGN10987+REGN10933 (NCT04426695, NCT04425629 и NCT04452318).

Симптомы нейродегенеративных заболеваний гетерогенны, что зачастую мешает постановке точного диагноза и подбору подходящей терапии. Ученые из США обработали данные о патологических изменениях (наличие нейрофибриллярных клубков, включения альфа-синуклеина, ангиопатия и т. д.) в посмертных образцах тканей мозга от 895 пациентов с помощью алгоритма кластеризации и выявили шесть кластеров заболеваний. Эти кластеры, выделенные лишь на основе гистопатологических данных, различались по когнитивным способностям пациентов, генотипам APOE и MAPT и уровню белков в спинномозговой жидкости. Используя полученные результаты, авторы обучили статистические модели определять принадлежность пациента к определенному кластеру на основе результатов анализов, полученных in vivo. Ученые считают, что разработанный ими подход дополняет существующие представления о симптомах и диагностике нейродегенеративных заболеваний. Кроме того, аналогичные схемы можно использовать для выделения подтипов латентных заболеваний в других областях медицины.

В апреле журнал Cellular&Molecular Immunology опубликовал статью исследователей из Фуданьского университета в Шанхае, в которой утверждалось, что коронавирус способен инфицировать Т-лимфоциты и индуцировать их апоптоз (подробнее на PCR.news). 10 июня статья была отозвана. В пояснении говорится, что «авторам следовало использовать первичные Т-клетки вместо Т-клеточных линий. Кроме того, есть опасения, что применяемая методология проточной цитометрии была ошибочной».

Городская станция переливания крови в Санкт-Петербурге объявила о приостановке формирования базы потенциальных доноров плазмы для лечения COVID-19. «В связи со снижением количества случаев заболевания новой коронавирусной инфекцией COVID-19 в Санкт-Петербурге и созданием запаса антиковидной плазмы в Городской станции переливания крови, с 3 августа 2020 года включение граждан в базу потенциальных доноров антиковидной плазмы временно приостанавливается», — говорится на странице станции ВКонтакте. О возобновлении работы по формированию базы будет сообщаться дополнительно.

Для безопасного возобновления работы школ в условиях пандемии COVID-19 необходим серологический контроль. Группа ученых из Италии предложила использовать сухие пятна крови для детекции антител к SARS-CoV-2 у учеников: такой метод малоинвазивен, а отобранные образцы не требуют сложных условий для хранения и транспортировки. Каплю капиллярной крови высушивают на фильтровальной бумаге при комнатной температуре. Для анализа кусочки бумаги с пятном крови инкубируют в буфере для ИФА, чтобы извлечь антитела, и проводят ИФА с помощью коммерческих наборов по инструкции производителя. Метод проверили на парных образцах сыворотки и сухих пятен крови от 52 работников здравоохранения. Анализ сыворотки выявил IgG к SARS-CoV-2 у 23 испытуемых, 28 образцов оказались отрицательными и для 1 образца результат был неоднозначен. Анализ сухих пятен дал похожий результат: 21 положительный образец, 28 отрицательных и 3 сомнительных, то есть данные, полученные двумя способами, согласуются на 96,2%. По мнению авторов, сухие пятна крови — достаточно надежный материал для серологических исследований, а простота отбора образцов позволяет охватить большее число участников.